时间:2018-3-5来源:本站原创 作者:佚名 点击: 61 次

中国菜豆凝集素序列的亲缘性分析

作者:韩雪,屈晓展,崔勇青,胡子颖(江汉大学生命科学学院;湖北省豆类(蔬菜)植物工程技术研究中心,湖北武汉)

摘要

菜豆凝集素可专一与寡糖结合,是其发挥凝血及杀虫功能的主要原因。将菜豆凝集素序列和其他豆科凝集素进行序列对比,发现菜豆凝集素与豇豆凝集素序列相似度最高。对不同国家产地凝集素序列进行对比分析,发现菜豆凝集素高度保守,高度相似氨基酸残基达到74%,中国株菜豆凝集素序列与马来西亚株菜豆凝集素相似度最高,进化树分析显示中国株菜豆凝集素其亲缘性追溯为发源于美洲(美国),经东南亚(马来西亚)传入中国,这与菜豆传入中国的历史相符合。

关键词

菜豆;凝集素;序列分析;进化树亲缘性

凝集素是一类广泛分布于动物、植物和微生物中的非免疫来源的糖结合蛋白,可以与糖类进行可逆性的结合[1]。目前已经发现的植物凝集素超过千种,广泛分布于豆科、茄科、百合科和石蒜科等植物类群中,其中豆科植物凝集素最丰富,有多种,是目前研究得最为清楚的凝集素家族。豆科凝集素主要存在于种子中,此外,还存在于叶片、茎皮、根中。所有豆科凝集素都由分子质量约为30ku的亚基组成的二聚体或四聚体,有1个糖结合位点[2]。

菜豆(PhaseolusvulgarisLinn.)又称四季豆,一年生草本植物,原产美洲,现在世界范围内广泛栽培,在中国已有多年的栽培历史[3],菜豆凝集素可以专一地与寡糖或糖复合物中的寡糖链结合,具有凝血活性,对人体有一定毒性作用[4-6],对一些植物病虫及病原微生物具有一定的抑制作用[7]。近来研究表明,菜豆凝集素中的血凝素可以特异性识别肿瘤细胞表面分子,有望在肿瘤检测方面发挥重要作用[8]。笔者通过对不同豆科植物的凝集素氨基酸序列进行对比分析,研究菜豆与其他豆科植物凝集素之间的亲缘性;同时,对不同国家和地区的菜豆凝集素序列进行对比,构建进化树,分析不同地区菜豆凝集素的相似度及中国地区菜豆凝集素的亲缘性,也从一个侧面分析中国菜豆品种的来源。

1材料与方法

1.1豆科植物凝集素序列

在蛋白质序列数据库PIR中,查找菜豆(







































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